隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展，各種先進(jìn)技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生（X 射線晶體衍射法、多維核磁共振法、掃描隧道顯微技術(shù)等），使得越來(lái)越多生物靶標(biāo)（蛋白質(zhì)、核酸、多糖等）的空間結(jié)構(gòu)被解析。同時(shí)計(jì)算機(jī)科學(xué)的發(fā)展又極大地提高了計(jì)算和分析的速度和精度。因此，自上世紀(jì)90 年代起，合理藥物設(shè)計(jì)就逐漸成為一種實(shí)用技術(shù)接融入到藥物研發(fā)的各個(gè)環(huán)節(jié)。